抗凝治疗。大面积肺栓塞、无溶栓禁忌证接受溶栓治疗，非大面积肺栓塞、无抗凝禁忌证接受抗凝治疗。抗凝常用药物有普通肝素、低分子肝素、Xa抑制剂、维生素K拮抗剂。应用普通肝素者监测活化的部分原时间（APTT），使之达到正常值的1.5~2.5倍，应用华法林监测国际标准化比值（INR），目标范围2.0~3.0。最常用的治疗是确诊肺栓塞后或高度怀疑肺栓塞时开始皮下注射低分子肝素，联合口服，3-5天后查凝血四项，INR连续两次达标、间隔24小时以上可停用低分子肝素，改为单一治疗，定期监测INR以调节用量。