公司与车主签订车辆租用协议，车主收取租金。公司所付租金可以在所得税前扣除，但必须取得正式发票；车主须到税务局申请开租赁业发票，缴纳增值税、城市维护建设税、教育费附加，并按“财产租赁所得”缴纳个人所得税。

1、根据《个人所得税法实施条例》（国务院令第600号）的规定，财产租赁所得，是指个人出租建筑物、土地使用权、机器设备、车船以及其他财产取得的所得。因此，个人出租车辆应当按照“财产租赁所得”项目缴纳个人所得税。

2、私车公用的情况下，企业可以与车主签订汽车租赁协议，协议中约定汽车在使用过程中发生的费用由企业承担。则相关的汽车油费、过路费、修理费开具公司的名称可以报销并在税前扣除。但以个人名义开具的发票，如保险费、车船使用税等不得在税前扣除。拓展资料：营业税改增值税，简称营改增，是指以前缴纳营业税的应税项目改成缴纳增值税。营改增的最大特点是减少重复征税，可以促使社会形成更好的良性循环，有利于企业降低税负。