根据中国国家卫生健康委员会中国医院等级查询系统查询可知，昆明市三级甲等医院有3个，分别是：昆明医科大学第二附属医院、昆明医科大学第一附属医院（云大医院）、云南省第一人民医院（昆华医院）。三级乙等医院有2个，分别是云南省第二人民医院（云南省红十字会医院）、云南省第三人民医院。三级未定等医院有2个，分别是昆明医科大学第三附属医院、云南省传染病专科医院。查询中的医院不包括军队医院和中医院。所以昆明三甲医院还应该加上云南省中医院、昆明市中医院和成都军区昆明总医院。

昆明医科大学第二附属医院

昆明医科大学第二附属医院是一家综合性医院，是昆明医科大学的临床医院，始建于1952年，位于西园路与滇缅大道交汇处，特色专科有内科和外科。

昆明医科大学第一附属医院（云大医院）

昆明医科大学第一附属医院是一家集医疗、科研、教学、保健于一体的综合性医院，是昆明医科大学的临床医院。始建于1941年，原名为国立云南大学医学院附属医院，简称为云大医院，2012年更改为现在的名字，但是云大医院的名字还是深入人心，位于西昌路上。特色专科有皮肤病科、生殖遗传科以及甲状腺外科。

云南省第一人民医院（昆华医院）

云南省第一人民医院（昆华医院）是一家集医疗、教学、科研、预防、指导基层和涉外服务为一体的综合性医院，始建于1939年，是云南省最早建立的公立医院，是昆明理工大学附属医院。位于金碧路上。特色专科有内分泌科、胸外科、呼吸内科。其中内分泌科全国排名第三。