毕业证和学位证清华深圳研究生院与本部一致。清华深研院其实就是清华的一个院系，所以清华深圳研究生院是很好的。

一般来说，在清华深圳研究生院的研究生都会在北京本部和深研院学习和生活。或者先在本部或者先在深研院。也可能随着导师课题的进展，在二者之间来回。在深研院的学生的补助比本部学生一般是要高不少。

清华大学深圳研究生院成立于2001年，座落于深圳市南山区西丽大学城。清华大学深圳研究生院是清华大学和深圳市合作创建的高层次人才培养基地和科技创新基地，直属清华大学，为清华大学唯一的异地办学机构，是清华大学教育改革的试验田和创建世界一流大学的重要组成部分。