标志上部图案以椭圆形玉佩状岩石为轮廓，配以绿，蓝，黄，褐相互交替，渐变过℃的色带，归纳表现了山，水，林，田，湖，草等自然生态元素，融合体现了生物圈，沉积岩，喀斯特，地质资料等相关概念。

图案中心使用了具有贵州代表性的古生物化石形象，左侧海百合与右侧贵州龙，共同组成篆体的“博”字，通过远古化石与人类文字的巧妙结合，突出博物馆博古通今，博采众长的文化特性。